Liebevoll gefertigte Tier-Präparate und anschauliche Modelle informieren über die Tier- und Pflanzenwelt rund um den See und darüber, was den Bodensee als Gewässer besonders macht. Gesteine aus den Alpen und Fossilien aus dem weltbekannten Steinbruch von Öhningen und anderen Fundstätten erzählen – rund um die eindrucksvolle Impression eines Vulkanschlots – von der spannenden geologischen Vergangenheit der Region. Hinzu kommen wechselnde Sonderausstellungen und das frei zugängliche Spiel- und Lerngelände „steine im fluss“ vor dem Museum.
Bodensee-Naturmuseum